Спустя два года после прощания с бакуганами Дэн и Маручо вновь оказываются в центре событий: Драго возвращается на Землю и просит друга о помощи — планету бакуганов Новую Вестрою захватили весты с планеты Вестал. Весты поработили бакуганов с помощью контроллеров измерения и держат их в подчинении.
Дэн и Маручо попадают в Новую Вестройю и объединяются с Фронтом Сопротивления Бакуганов во главе с Мирой Фермен — они борются за свободу бакуганов. Героям предстоит сразиться с элитной командой вестов — Вексами, уничтожить контроллеры в городах-колониях и противостоять коварным планам короля Зеногелда, который хочет стереть бакуганов с лица вселенной. В битвах раскрываются новые силы бакуганов, появляются кибер‑бакуганы и бакуганы‑ловушки, а дружба и верность становятся не менее важным оружием, чем G‑сила.